Markus Unger besuchte die Johannes-Neuhäusler-Schule in Schönbrunn. Während seiner Schulzeit nahm er mit Begeisterung an verschiedenen Theaterprojekten teil. Dabei entdeckte er seine Liebe zum Theater.

2020 absolvierte er ein Praktikum bei der Freien Bühne München und spielte im Szenenstudium zu Ingrid Lausunds Hysterikon die Rolle des Richard. In seinem Orientierungsjahr bei der FBM lernte er die Arbeiten Karl Valentins kennen. Er spielte die Rolle des Trinculo aus Der Sturm von William Shakespeare, die Rolle des Capponi aus Arthur Schnitzlers Die Schleier der Beatrice und die des Kriminalkommissars aus Die Physiker von Friedrich Dürrenmatt. In der Theaterproduktion Der Meister und Margarita spielte er die Rolle des Iwan Besdomny. Seit 2024 macht Markus Unger eine Ausbildung zum Schauspielberuf bei Freie Bühne München.